由國家科技部批准，於2011年1月25日正式掛牌成立，是我國中醫藥領域成立的首個國家重點實驗室。中藥質量研究國家重點實驗室的成立是中央政府致力推進中醫藥國際化發展，促進澳門經濟發展適度多元化和提升澳門科技水平的重要舉措。重點實驗室以成為具有國際先進水平的中藥質量和創新藥物研究基地、獲取原始創新研究成果和自主知識產權、匯聚和培育中醫藥優秀人才以及拓展國際高水平學術交流與合作為目標。近年來積極開展交流與合作，已與17間知名教研機構建立聯合實驗室或研究中心，並獲得澳大利亞NATA/ISO17025認證。

2020年9月，設立澳門科技大學中藥質量研究國家重點實驗室（澳門科技大學）橫琴分部。

重點研究方向：中藥質量評價的新技術和新方法、新發病機制與中藥新靶點、中藥新型遞送系統、中藥安全性評價和創新藥物研發與轉化研究等方面均取得了多項重要進展。其中，在中藥小核酸新藥研發、食藥同源中藥研究、破解中老年類風關高發率等方面取得重大成果。

科研成果：迄今共獲各級各類獎勵63項，2022年澳門特別行政區授予專業功績勳章以表揚在專業上對澳門特別行政區作出的傑出貢獻。發表澳門首篇Nature文章，迄今共發表SCI期刊論文2332篇，專利授權248項，且注重產業化應用。例如：與廣州醫科大學、廣州醫藥集團（廣藥集團）合作研發的白雲山複方板藍根顆粒（低糖）成功獲批澳門中成藥註冊證，這也是自澳門《中藥藥事活動及中成藥註冊法》實施，以及澳門藥物監督管理局揭牌成立以來，頒佈的第一個口服創新型同名同方新藥批文。姜志宏講座教授首次發現人參tRNA片段可通過靶向MIAT/VEGFA通路，降低心臟缺血/再灌注損傷, 對源於人參的tRNA結構及其藥理作用進行了系統研究，發現編號HC83的RNA片段心肌保護作用是陽性藥的500倍。該分子可通過MIAT-VEGFA通路產生心肌保護活性，闡明了中藥小核酸產生心肌保護活性的新機制。該研究已獲中國、澳洲和美國專利授權，並簽約轉讓給澳門德誠生物技術有限公司。EN002是姜志宏講座教授團隊發現的一種紅樹林藥用植物中的甾體化合物, 能有效抑制DNA複製起始蛋白（DRIPs）蛋白活性以及DNA複製。 與當今市面上傳統化療藥以及靶向藥物相比，EN002藥效更好，適應症更廣。 於2021年8月獲得國家藥品監督管理局藥品審評中心的I/II期臨床批件，用於治療非黑色素瘤皮膚癌及癌前病變的，目前已完成以中國和澳洲為主的國際多中心I期臨床研究，II期臨床研究正在積極啟動中。臨床前體內及體外試驗結果表明，EN002與其靶標蛋白結合，可以在對正常細胞損傷較小的情況下使癌細胞凋亡。結果也顯示其藥效優於許多目前一線抗腫瘤藥物，而且能有效抑制肝癌、胃癌、肺癌、宮頸癌、前列腺癌、皮膚癌等10餘種腫瘤細胞。

2020年還獲得政府專項資助計劃建立了諾獎獲得者工作站 “埃爾文·內爾博士生物物理與創新藥物實驗室”。埃爾文·內爾教授是1991年諾貝爾生理學及醫學獎得主，曾獲得1920個國內外學術機構榮譽博士學位，中國科學院第一位“愛因斯坦教授”，是研究離子通道和囊泡運輸的先驅。