由国家科技部批准，于2011年1月25日正式挂牌成立，是我国中医药领域成立的首个国家重点实验室。中药质量研究国家重点实验室的成立是中央政府致力推进中医药国际化发展，促进澳门经济发展适度多元化和提升澳门科技水平的重要举措。重点实验室以成为具有国际先进水平的中药质量和创新药物研究基地、获取原始创新研究成果和自主知识产权、汇聚和培育中医药优秀人才以及拓展国际高水平学术交流与合作为目标。近年来积极开展交流与合作，已与17间知名教研机构建立联合实验室或研究中心，并获得澳大利亚NATA/ISO17025认证。

2020年9月，设立澳门科技大学中药质量研究国家重点实验室（澳门科技大学）横琴分部。

重点研究方向：中药质量评价的新技术和新方法、新发病机制与中药新靶点、中药新型递送系统、中药安全性评价和创新药物研发与转化研究等方面均取得了多项重要进展。其中，在中药小核酸新药研发、食药同源中药研究、破解中老年类风关高发率等方面取得重大成果。

科研成果：迄今共获各级各类奖励63项，2022年澳门特别行政区授予专业功绩勋章以表扬在专业上对澳门特别行政区作出的杰出贡献。发表澳门首篇Nature文章，迄今共发表SCI期刊论文2332篇，专利授权248项，且注重产业化应用。例如：与广州医科大学、广州医药集团（广药集团）合作研发的白云山复方板蓝根颗粒（低糖）成功获批澳门中成药注册证，这也是自澳门《中药药事活动及中成药注册法》实施，以及澳门药物监督管理局揭牌成立以来，颁布的第一个口服创新型同名同方新药批文。姜志宏讲座教授首次发现人参tRNA片段可通过靶向MIAT/VEGFA通路，降低心脏缺血/再灌注损伤, 对源于人参的tRNA结构及其药理作用进行了系统研究，发现编号HC83的RNA片段心肌保护作用是阳性药的500倍。该分子可通过MIAT-VEGFA通路产生心肌保护活性，阐明了中药小核酸产生心肌保护活性的新机制。该研究已获中国、澳洲和美国专利授权，并签约转让给澳门德诚生物技术有限公司。EN002是姜志宏讲座教授团队发现的一种红树林药用植物中的甾体化合物, 能有效抑制DNA复制起始蛋白（DRIPs）蛋白活性以及DNA复制。 与当今市面上传统化疗药以及靶向药物相比，EN002药效更好，适应症更广。 于2021年8月获得国家药品监督管理局药品审评中心的I/II期临床批件，用于治疗非黑色素瘤皮肤癌及癌前病变的，目前已完成以中国和澳洲为主的国际多中心I期临床研究，II期临床研究正在积极启动中。临床前体内及体外试验结果表明，EN002与其靶标蛋白结合，可以在对正常细胞损伤较小的情况下使癌细胞凋亡。结果也显示其药效优于许多目前一线抗肿瘤药物，而且能有效抑制肝癌、胃癌、肺癌、宫颈癌、前列腺癌、皮肤癌等10余种肿瘤细胞。

2020年还获得政府专项资助计划建立了诺奖获得者工作站 “埃尔文·内尔博士生物物理与创新药物实验室”。埃尔文·内尔教授是1991年诺贝尔生理学及医学奖得主，曾获得1920个国内外学术机构荣誉博士学位，中国科学院第一位“爱因斯坦教授”，是研究离子通道和囊泡运输的先驱。