为贯彻落实国家《横琴粤澳深度合作区建设总体方案》和《粤港澳大湾区发展规划纲要》，助力澳门经济适度多元发展和大湾区国际创新中心建设，积极推进澳门参与“广深港澳科技创新走廊”建设，澳门科技大学在横琴粤澳深度合作区建设集科学研究、产业孵化、人才聚集为一体的综合性、国际化产学研示范基地——橫琴粵澳深度合作区澳科大创新科技研究院。

橫琴粤澳深度合作区澳科大创新科技研究院依托澳门科技大学的教学科研基础，现有两个全国重点实验室分部、超20个创新工程领域科研平台，围绕大健康、生物医药、现代中医药、新材料、人工智能、太空研究与应用等核心产业发展需求，开展面向产业应用的前沿科技创新和重点领域科研成果转化，广泛凝聚资源致力产业人才培养聚集，努力建成具有示范效应的综合创新平台。